Le Scuole di Dottorato hanno lo scopo di promuovere, organizzare e gestire tutte le attività connesse ai dottorati di ricerca. Attualmente sono istituite 26 Scuole, ciascuna articolata in corsi di dottorato che sono finalizzati all'acquisizione delle metodologie della ricerca scientifica, favorendo l'utilizzazione di nuove tecnologie, i soggiorni di studio all'estero e le esperienze presso enti pubblici e privati. Tali corsi forniscono le competenze necessarie per esercitare attività di ricerca di alta qualificazione.